Dieser Rechner war als leistungsfähigere Version des Falcon 030 geplant. Erstmals wollte Atari den Motorola MC68040 als Prozessor einzusetzen. Die Taktrate ist leider unbekannt. Leicht erweiterbar sollte der Rechner durch PCI Steckplätze werden, welche im Falcon 040 jedoch nicht dem akt. PCI Standard entsprachen. Mehrere Erweiterungskarten für den Rechner wurden wohl schon entwickelt. Leider kam der der Falcon 040 nicht mehr auf den Markt, da Atari die Computerherstellung einstellte und sich nur noch auf die Atari Jaguar Spielekonsole konzentrierte
